Заседание 16 (29) августа по просьбе японской делегации началось ссекретного совещания уполномоченных. Комура Ютаро заявил о согласии японского правительства с предложениями русской делегации. Затем открылось заседание в обычном порядке, с участием секретарей. С. Ю. Витте зачитал русскую ноту, в которой указывалось, что император, "желая явить новое доказательство своего искреннего желания содействовать восстановлению мира на Дальнем Востоке, соглашается уступить Японии южную часть острова Сахалин с тем, чтобы северная его часть оставалась во владении России без всякого вознаграждения". В ноте оговаривалось, что Япония должна будет в этом случае гарантировать свободу мореплавания в проливе Лаперуза и обязуется не принимать никаких военных мер на занятой ею части Сахалина (см. [65, с. 72-73 ; 41, д. 764, с. 122-123; 121, 1918, № 9, с. 75]). Японские уполномоченные потребовали, чтобы заключавшаяся в русской ноте оговорка в отношении непринятия военных мер и обязательство обеспечения свободного плавания по проливу Лаперуза и Татарскому проливу были взаимны (см. [341, д. 764, с. 123; 65, с. 73]). С. Ю. Витте не возражал. Таким образом, узловой спорный вопрос был решен и мир достигнут.
Итоги переговорам С. Ю. Витте подвел в интервью, которое дал корреспонденту "Ассошиэйтед пресс" сразу же после окончания утреннего заседания. Первое, что он выделил и подчеркнул, был вопрос о контрибуции: "Мы не заплатили ни копейки". Далее он упомянул о тех пунктах требований Японии, которые русской делегацией не были приняты: о выдаче интернированных судов, об ограничении морских сил и т. д. Все интервью было выдержано в таких тонах, словно не царская Россия приносила жертвы, а Япония. О значении потери южной части Сахалина С. Ю. Витте почти ни словом не обмолвился, указав лишь на то, что уступил южную часть Сахалина только по приказу царя. В заключение С. Ю. Витте сказал, что его предложения "были русским ультиматумом, и он был принят японцами" (цит. по [365, с. 262-263]).
Мир был подписан на условиях, предложенных царским правительством, и в этом Витте был прав. Но он не договаривал, что эти условия были крупными уступками, которые делала Россия, будучи страной, потерпевшей поражение. "Фокусник" и "акробат" Витте, как его называл в своих работах В. И. Ленин, в целях саморекламы сразу же начал превозносить результаты Портсмутской конференции, изображая даже потери русской территории в качестве успеха России.
После разрешения наиболее существенных вопросов, от которых могло зависеть прекращение или продолжение войны, конференции предстояло заняться рассмотрением так называемых второстепенных вопросов, из которых, например, вопрос об обмене военнопленными и уплате вознаграждения за содержание военнопленных представлял немалое значение: под прикрытием последнего японская сторона могла попытаться протащить требование фактической уплаты контрибуции.
В окончательном тексте статьи по этому вопросу говорилось: "Российское и японское правительства представят друг другу... документально оправданный счет прямых расходов, произведенных каждым из них по уходу за пленными и их содержанию со дня пленения или сдачи до дня смерти или возвращения" (ст. 13) [65, с. 104].
В приложении № 10 к Портсмутскому договору указывалось, что все торговые договоры между Японией и Россией аннулированы. Пока не будет заключен новый договор о торговле и мореплавании, стороны договорились одобрить как основу их торговых отношений режим наиболее благоприятствуемой нации (см. [85, т. 8, прил., с. 294]).
На заседании конференции 23 августа (5 сентября) 1905 г. состоялось подписание договора. Ратифицирован он был одновременно японским и русским императорами 1 (14) октября 1905 г.
Так закончилась война, вероломно начатая японскими милитаристами. Ранее утвердившись на Курильских островах, на сей раз они отторгли от России южную половину Сахалина - исконно русскую территорию, важный форпост обороны России на Тихом океане. Нападением на Россию Япония порвала договоры 1855 и 1875 гг., предусматривавшие поддержание добрососедских и дружественных отношений между двумя странами. В Симодском трактате 1855 г. указывалось: "Отныне да будет постоянный мир и искренняя дружба между Россией и Японией". В Петербургском трактате 1875 г. была записана цель его заключения: упрочить "существующее доброе согласие". Порвав договоры 1855 и 1875 гг., Япония потеряла тем самым и всякое право ссылаться на них.
Передача Японии южной части Сахалина, важного стратегического рубежа России на Тихом океане, означала серьезное поражение царского правительства.
С. Ю. Витте лишь удалось добиться, чтобы Япония взяла на себя ряд важных обязательств: демилитаризировать русско-корейскую границу, использовать Маньчжурские железные дороги в коммерческих целях, не строить укреплений на южной части Сахалина и у пролива Лаперуза, что впоследствии сыграло известную роль в деле некоторого ограничения агрессивных действий японских милитаристов.